科技专项审计主要应关注方面：

1、政府和部门贯彻落实科技创新政策情况

2、科技投入和资金拨付情况。

3、财政科技等部门资金分配使用情况。

4、科技项目实施情况。

5、科技项目验收与绩效评价情况。

6、科技成果转化情况。